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  • 文件权限问题导致plink报错 Failed to open 21JAN.log. Try changing the --out parameter.

晚上兴起,想起一直以来没有解决的问题,于是复制一个目录,开始跑数据,但是跑到第一步就采坑

plink --chr-set 95 --file merge --mind 0.1 --geno 0.1 --maf 0.05 --chr 1-18 --recode --out 21JAN

报错,(没有复制全)

Failed to open 21JAN.log. Try changing the --out parameter.

找了半天原因,网上也没找到,后来想起可能是权限问题,于是

sudo chmod -R 777 testyy

居然跑通了

把权限改到755 ,错误又变了

PLINK v1.90b6.22 64-bit (16 Apr 2021)          www.cog-genomics.org/plink/1.9/
(C) 2005-2021 Shaun Purcell, Christopher Chang   GNU General Public License v3
Logging to 21JAN.log.
Options in effect:
   --chr 1-18
   --chr-set 95
   --file merge
   --geno 0.1
   --maf 0.05
   --mind 0.1
   --out 21JAN
   --recode

31470 MB RAM detected; reserving 15735 MB for main workspace.

 

出处:https://www.cnblogs.com/jilingxf/p/15837897.html

 


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